Целями деятельности Департамента являются:

1. высокий уровень развития предпринимательства и эффективная инновационная политика Томской области, обеспечивающая конкурентоспособность секторов экономики;

2. высокий уровень развития и эффективное использование научно-технического и инновационного потенциала организаций научно-образовательного комплекса Томской области, субъектов инновационной деятельности.

Задачами деятельности Департамента являются:

• формирование и развитие инфраструктуры поддержки предпринимательства;
• создание благоприятных условий и устранение барьеров для развития бизнеса;
• формирование позитивного образа предпринимательской деятельности (пропаганда и популяризация предпринимательской деятельности);
• создание новых экономических субъектов в приоритетных секторах экономики;
• создание условий для развития и реализации научно-технического и инновационного потенциала организаций НОК, субъектов инновационной деятельности;
• создание условий для вовлечения в экономический оборот результатов интеллектуальной деятельности, созданных в организациях НОК, субъектов инновационной деятельности;
• совершенствование региональной инновационной системы;
• повышение инновационной активности и восприимчивости организаций к инновациям;
• создание условий для развития и реализации кластерной политики в инновационной сфере, системы венчурного финансирования.